南村镇与广州市天河区、海珠区隔江相望，南距市桥10公里，镇域面积47平方公里，丘陵台地面积占75.9%、三角洲冲积平原占21.7%、水面占2.4%，海拔146米的大镇岗是全镇的最高点。